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预定义算法 De Novo Software价格
来自 : 发布时间:2024-05-05

预定义算法轻松使用预组装工具进行分析想要使用最新方法准备和分析数据的研究人员将不会不再受到复杂编程要求的阻碍。 FCS Express 在我们的新管道中为 FlowAI、FlowCut、FlowSOM、SPADE 或 Phenograph 提供预定义算法。跳过复杂的脚本,停止使用 R,或担心编程。借助 FCS Express 中的这些预定义算法,您只需单击几下即可准备数据文件并执行高级分析 - 无需插件。开始免费试用

FlowCutFlowCut 允许用户对流量执行质量控制细胞计数数据,以改进手动和自动下游分析。 FlowCut 是一个两步过程:首先删除事件较少的采集区域,然后根据多个质量控制测试清理剩余数据。

FlowAIFlowAI 是一种自动交互式工具,用于从数据文件中删除异常值和异常值,可随时在 FCS Express 中使用。此预定义的管道步骤包括流量检查、信号采集和动态范围质量控制。删除这些质量较低的事件可以改进下游基础和高级分析,同时在 FCS Express 中生成卓越、可靠且可重复的结果。

FlowSOM 现在可通过 FCS Express Pipelines 作为预定义算法进行访问,FlowSOM 是一种聚类和可视化工具,有助于分析高维数据。聚类是基于批自组织映射 (Batch Self-Organizing Map) 定义的 ( Batch-SOM)算法,这是经典自组织映射算法的增强实现。然后将簇排列在最小生成树中,这可以帮助研究人员了解其面板中包含的标记的行为方式保存在所有细胞上。还执行第二个聚类步骤(即元聚类),这可以为辨别生物相似性提供基础,并可以帮助检测可能被遗漏的组。

SPADESPADE(密度归一化事件的生成树进展分析)是一种聚类算法,是对 FCS Express 中现有分析方法的补充。作为预定义的流程步骤,FCS Express 用户可以轻松自动识别多维细胞计数数据文件中的细胞群,而无需分配已知的细胞顺序。

PhenographPhenograph是一种有助于高维数据分析的聚类工具。 Phenograph 首先用图结构表示高维数据集。在这种表示中,每个单元都表示为一个节点,并连接到其邻居(即最模拟的单元)ilar to it)通过一条边,其权重由单元格之间的相似性设置。在此图中,单元的密集区域将表现为高度互连(即边缘高密度)的模块。构建完成后,该图将被划分为紧密互连的模块子集(称为社区),它们代表不同的表型亚群。

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发布于 : 2024-05-05 阅读()